taxonomie des bacterie
TAXONOMIE BACTERIENNE
TAXONOMIE BACTERIENNE
Commentaires
(Référentiel 2007)
Principes d’identification, règles de nomenclature : La taxonomie est évolutive et on s’efforcera d’expliquer cette évolution en s’appuyant sur des exemples.
Supports de la classification phénotypique : On traitera dans cette optique : - la structure et la composition de la paroi ; - les antigènes somatiques et flagellaires ; - les caractères métaboliques. Ces données seront mises en rapport avec l’identification. A cette occasion on abordera la taxonomie numérique.
Supports de la classification génotypique : On envisagera pour les acides nucléiques : la détermination du GC%, de l’ARN 16 S, les techniques d’hybridation, l’étude des profils de restriction, les techniques d’amplification par PCR.
Repères
(Inspection pédagogique 15/12/2008)
Montrer l'évolution de la taxonomie phénotypique vers la taxonomie génotypique, à l'aide d'un exemple, tel que celui du genre Pseudomonas
Pour les méthodes de biologie moléculaire : se contenter de les citer, d'indiquer leur intérêt et leurs limites dans le cadre de leur application à l'identification génotypique.
Sommaire
Introduction ........................................................................................................................................................................................ 2
1
2
3
4
5
Les rangs taxinomiques bactériens et leurs nomenclatures ....................................................................................................... 2
1.1
Rangs taxonomiques (tableau 1) ....................................................................................................................................... 2
1.2
Règles de nomenclature .................................................................................................................................................... 2
1.3
Notion d’espèce (tableaux 2 et 3 – figure